DesktopVPNサーバを必要なときに起動し、必要でなくなったら終了させたいのですが。

DesktopVPNサーバの設定ツールに、「接続を許可する」と「接続を禁止する」ボタンを用意していますので、必要ないときに接続されることを禁止することができます。